La chiesa di san Domenico, annessa al monastero omonimo, è situata quasi all'inizio della cittadina. Edificata sotto l'episcopato di Berardo (1311 - 1322), fu affidata ai Padri domenicani. La chiesa era anticamente appoggiata alla grande porta d'ingresso posta a oriente della città di Troia e che portava a Foggia. Ha la facciata molto semplice con un portale di ingresso in pietra verde di Roseto, sovrastato da un timpano spezzato nell'apice. Al di sopra di questo è inserita una lapide che con caratteri gotici descrive la sua costruzione e racconta che la stessa chiesa era stata eretta in onore di San Girolamo.

• Coperture
  • La copertura è stata totalmente rinnovata ed è ora tutta fatta da capriate in legno a vista. La nuova copertura sostituisce la vecchia copertura sempre in legno ma molto rovinata per le infiltrazioni piovane. L'ultima sistemazione, consistente nell'applicazione sotto il tavolato delle capriate di un controsoffitto intonacato su rete metallica, è stata fatta sotto l'episcopato di Mons. Farina (1919 - 1951), e risente di un mediocre gusto artistico e risale agli anni cinquanta del 1900. Anche le pareti sono state decorate con elementi geometrici, mentre il pavimento è stato realizzato con piastrelle in granigliato di cemento.
• Impianto strutturale
  • La chiesa è a navata unica, su di essa insistono due altari in massa di fabbrica con marmi policromi. Nella navata si apre una piccola cappella laterale dedicata alla Vergine.
• Elementi decorativi
  • Nel periodo barocco la chiesa è stata arricchita da un altare maggiore in marmi policromi nel cui paliotto si sbalza scolpita finemente l'immagine di San Girolamo penitente. Preziosa ed elegante è la balaustra con due entrate nel presbiterio. Di recente, sulla parete di destra immediatamente subito dopo l'ingresso, è venuta alla luce, sotto l'intonaco, una parete affrescata di ottima fattura.

• XIV ‐ 1312 (reaturo carattere generale)
  • La chiesa di San Domenico fu edificata nel 1312, in un periodo di decadenza morale durante l'episcopato di Berardo (1311-1322). Così recita l'epigrafe gotica murata nella facciata: "+A(nno) D(omini) MCCCXII IND(ctione) X REGNANTE GL(orio)SISSIMO D(omi)NO N(ost)RO REGE ROBE(r)TO / HAEC ECCL(es)IA AD H(ono)RE(m) DEI ET BEATI HIERO(n)YMI DOCTOIS EGREGII S(ancta)E E(cclesia)E FABRICATA E(st) IP(s)O REVELANTE / IN TROJANA CIVITATE E(isco)PO BERALDO"
• XVIII ‐ 1702 (restauro carattere generale)
  • Nel 1702 veniva realizzata il nuovo ingresso della chiesa, così come recita l'architrave della stessa: "ERECTU(m) FUIT HOSTIU(m) HOC DOMINA(n)TE IN HAC CIVI(ta)TE ILL(ustrissi)MO ET ECC(e)LL(entissimo) D(omi)N(o) / IOANE D'AVALOS D'AQU(i)NO Y D'ARAGONA SIMUL CU(m) ECC(ellentissi)MA ET PY(i)SS(i)MA UXORE EIUS D(om)NA D(?) / D'AVALOS TED(?) PRIOR(is) AD(?) R(eve)R(endissini) L(?) F(atris) THEA(tini) ALOYSY PADULA DE MA(n)TEMURRO DIER (septem)BRIS 1702"
• XIX ‐ 1950-1955 (restauro carattere generale)
  • Negli anni cinquanta del secolo scorso, sotto l'episcopato di Mons. Fortunato Maria Farina, è stato applicato sotto il tavolato delle capriate un controsoffitto intonacato su rete metallica decorato come fosse un "cassettonato", il pavimento è stato rifatto con piastrelle in granigliato di cemento.
• XXI ‐ 2012 (restauro carattere generale)
  • Nell'aprile del 2012, sotto l'episcopato di Mons. Domenico Cornacchia, sono iniziati i lavori di riparazione delle coperture e riqualificazione dei fronti prospettici. L'intervento, grazie al contributo della CEI, ha interessato i seguenti lavori: consolidamento delle capriate e rifacimento della copertura; consolidamento e riqualificazione dei prospetti; revisione infissi; consolidamento e restauro dei cantonali e del portale principale in pietra.